Това е една от най-сериозните инвестиции за развитие на българската наука и все още представлява най-скъпата научна инвестиция на Българската академия на науките. Обсерваторията продължава и до днес да е най-голямата институция в България за професионални астрономически изследвания, както и най-големият астрономически комплекс в Югоизточна Европа. Националната астрономическа обсерватория (НАО) Рожен е неделима част от Институт по астрономия (ИА) при Българска академия на науките (БАН). Предметът на дейност на ИА с НАО включва фундаментални научни изследвания в областта на астрономията и астрофизиката, провеждани чрез наблюдения и теоретични изследвания на произхода и еволюцията на космическите обекти.